Hamiltonian adaptive resolution simulation for molecular liquids

Adaptive resolution schemes allow the simulation of a molecular fluid treating simultaneously different subregions of the system at different levels of resolution. In this work we present a new scheme formulated in terms of a global Hamiltonian. Within this approach equilibrium states corresponding to well defined statistical ensembles can be generated making use of all standard Molecular Dynamics or Monte Carlo methods. Models at different resolutions can thus be coupled, and thermodynamic equilibrium can be modulated keeping each region at desired pressure or density without disrupting the Hamiltonian framework.Comment: 11 pages, 3 Figure

The AI Settlement Generation Challenge in Minecraft : First Year Report

© 2020 Springer-Verlag. This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in KI - Künstliche Intelligenz. The final authenticated version is available online at: https://doi.org/10.1007/s13218-020-00635-0.This article outlines what we learned from the first year of the AI Settlement Generation Competition in Minecraft, a competition about producing AI programs that can generate interesting settlements in Minecraft for an unseen map. This challenge seeks to focus research into adaptive and holistic procedural content generation. Generating Minecraft towns and villages given existing maps is a suitable task for this, as it requires the generated content to be adaptive, functional, evocative and aesthetic at the same time. Here, we present the results from the first iteration of the competition. We discuss the evaluation methodology, present the different technical approaches by the competitors, and outline the open problems.Peer reviewedFinal Accepted Versio

Tracking pan-continental trends in environmental contamination using sentinel raptors — what types of samples should we use?

Biomonitoring using birds of prey as sentinel species has been mooted as a way to evaluate the success of European Union directives that are designed to protect people and the environment across Europe from industrial contaminants and pesticides. No such pan-European evaluation currently exists. Coordination of such large scale monitoring would require harmonisation across multiple countries of the types of samples collected and analysed-matrices vary in the ease with which they can be collected and the information they provide. We report the first ever pan-European assessment of which raptor samples are collected across Europe and review their suitability for biomonitoring. Currently, some 182 monitoring programmes across 33 European countries collect a variety of raptor samples, and we discuss the relative merits of each for monitoring current priority and emerging compounds. Of the matrices collected, blood and liver are used most extensively for quantifying trends in recent and longer-term contaminant exposure, respectively. These matrices are potentially the most effective for pan-European biomonitoring but are not so widely and frequently collected as others. We found that failed eggs and feathers are the most widely collected samples. Because of this ubiquity, they may provide the best opportunities for widescale biomonitoring, although neither is suitable for all compounds. We advocate piloting pan-European monitoring of selected priority compounds using these matrices and developing read-across approaches to accommodate any effects that trophic pathway and species differences in accumulation may have on our ability to track environmental trends in contaminants

Estudio de la aleación Fe-1%Si mediante moldeo por inyección de polvo para su aplicación en el núcleo de dispositivos electromagnéticos-mecánicos

Este estudio tuvo como objetivo estudiar la aleación de Fe-1%Si obtenida del Moldeo por Inyección de Polvo (MPI), que puede ser utilizada en el núcleo de dispositivos electromagnéticos-mecánicos como motores, generadores, transformadores, relés, altavoces y micrófonos, entre otros. El estudio comprendió la obtención (preparación de carga, inyección, extracción química y térmica y sinterización), análisis de propiedades físicas de interés, como propiedades magnéticas, resistividad eléctrica, dureza y análisis micrográfico a partir de metalografía en microscopio óptico y SEM (microscopía de escaneo electrónico). Los resultados se compararon con la misma aleación Fe-1%Si obtenida de los procesos de Metalurgia convencional, es decir, compactación y sinterización.This study aimed to study the Fe-1%Si alloy obtained from Powder Injection Molding (MPI), which can be used in the core of electromagnetic-mechanical devices such as motors, generators, transformers, relays, speakers and microphones, among others. The study comprised obtaining (load preparation, injection, chemical and thermal extraction, and sintering), analysis of physical properties of interest, such as magnetic properties, electrical resistivity, hardness and micrographic analysis from metallography in an optical microscope and SEM (Microscope) Scanning Electronic. The results were compared to the same Fe-1%Si alloy obtained from the processes of conventional Metallurgy that is, compaction and sintering.Este trabalho teve por objetivo o estudo da liga Fe-1%Si obtido a partir da Moldagem de Pós por Injeção (MPI), possível de ser utilizado em núcleo de dispositivos eletromagneto-mecânicos como motores, geradores, transformadores, relés, alto falantes e microfones, entre outros. O estudo compreendeu a obtenção (preparação da carga, injeção, extração química e térmica, e sinterização), análise de propriedades físicas de interesse, como propriedades magnéticas, resistividade elétrica, dureza e análise micrográfica a partir de metalografia em microscópio ótico e MEV (Microscópio Eletrônico de Varredura). Os resultados foram comparados a mesma liga de Fe-1%Si obtido a partir dos processos da Metalurgia convencional: compactação e sinterização

Trypanosoma brucei PUF9 Regulates mRNAs for Proteins Involved in Replicative Processes over the Cell Cycle

Many genes that are required at specific points in the cell cycle exhibit cell cycle–dependent expression. In the early-diverging model eukaryote and important human pathogen Trypanosoma brucei, regulation of gene expression in the cell cycle and other processes is almost entirely post-transcriptional. Here, we show that the T. brucei RNA-binding protein PUF9 stabilizes certain transcripts during S-phase. Target transcripts of PUF9—LIGKA, PNT1 and PNT2—were identified by affinity purification with TAP-tagged PUF9. RNAi against PUF9 caused an accumulation of cells in G2/M phase and unexpectedly destabilized the PUF9 target mRNAs, despite the fact that most known Puf-domain proteins promote degradation of their target mRNAs. The levels of the PUF9-regulated transcripts were cell cycle dependent, peaking in mid- to late- S-phase, and this effect was abolished when PUF9 was targeted by RNAi. The sequence UUGUACC was over-represented in the 3′ UTRs of PUF9 targets; a point mutation in this motif abolished PUF9-dependent stabilization of a reporter transcript carrying the PNT1 3′ UTR. LIGKA is involved in replication of the kinetoplast, and here we show that PNT1 is also kinetoplast-associated and its over-expression causes kinetoplast-related defects, while PNT2 is localized to the nucleus in G1 phase and redistributes to the mitotic spindle during mitosis. PUF9 targets may constitute a post-transcriptional regulon, encoding proteins involved in temporally coordinated replicative processes in early G2 phase

Reorganizing the Intrinsic Functional Architecture of the Human Primary Motor Cortex during Rest with Non-Invasive Cortical Stimulation

The primary motor cortex (M1) is the main effector structure implicated in the generation of voluntary movements and is directly involved in motor learning. The intrinsic horizontal neuronal connections of M1 exhibit short-term and long-term plasticity, which is a strong substrate for learning-related map reorganization. Transcranial direct current stimulation (tDCS) applied for few minutes over M1 has been shown to induce relatively long-lasting plastic alterations and to modulate motor performance. Here we test the hypothesis that the relatively long-lasting synaptic modification induced by tDCS over M1 results in the alteration of associations among populations of M1 neurons which may be reflected in changes of its functional architecture. fMRI resting-state datasets were acquired immediately before and after 10 minutes of tDCS during rest, with the anode/cathode placed over the left M1. For each functional dataset, grey-matter voxels belonging to Brodmann area 4 (BA4) were labelled and afterwards BA4 voxel-based synchronization matrices were calculated and thresholded to construct undirected graphs. Nodal network parameters which characterize the architecture of functional networks (connectivity degree, clustering coefficient and characteristic path-length) were computed, transformed to volume maps and compared before and after stimulation. At the dorsolateral-BA4 region cathodal tDCS boosted local connectedness, while anodal-tDCS enhanced long distance functional communication within M1. Additionally, the more efficient the functional architecture of M1 was at baseline, the more efficient the tDCS-induced functional modulations were. In summary, we show here that it is possible to non-invasively reorganize the intrinsic functional architecture of M1, and to image such alterations

Abordagens para Prevenção Secundária do Tromboembolismo Pulmonar (TEP): Uma Revisão de Literatura

This literature review aims to investigate contemporary strategies for the secondary prevention of Pulmonary Embolism (PE). The research encompassed recent studies, focusing on anticoagulation, including novel oral anticoagulants, surgical interventions, and advanced diagnostic methods. Emphasizing the importance of personalized treatment considering individual factors, the review underscores the need for additional studies to validate conclusions and inform more robust clinical guidelines. This review contributes to an in-depth understanding of secondary prevention strategies for PE, highlighting the integrated and personalized approach as crucial for optimizing clinical outcomes and reducing PE recurrence.Esta revisão de literatura explora estratégias contemporâneas para a prevenção secundária do Tromboembolismo Pulmonar (TEP). A pesquisa abrangeu estudos recentes, enfocando anticoagulação, incluindo novos anticoagulantes orais, intervenções cirúrgicas, e métodos de diagnóstico avançados. Destaca-se a importância da personalização do tratamento, considerando fatores individuais, enquanto ressalta a necessidade de estudos adicionais para validar conclusões e informar diretrizes clínicas mais sólidas. Esta revisão contribui para uma compreensão aprofundada das estratégias de prevenção secundária do TEP, enfatizando a abordagem integrada e personalizada como crucial para otimizar desfechos clínicos e reduzir recorrências do TEP

A antecipação da tutela fundada na evidência

Esta monografia faz um breve apanhado sobre a antecipação da tutela fundada na evidência, ou seja, à aplicação de uma técnica antecipatória voltada a entregar tutela jurisdicional em tempo razoável tão logo o direito seja evidenciado. O processo é instrumento que se desenvolve em contraditório, obedecendo ritos que se destinam à tornar madura a causa em julgamento e que confira segurança jurídica às partes para que possam exercer adequadamente suas responsabilidades processuais. Além disso, deve obedecer um tempo de tramitação que permita a correta distribuição de responsabilidades entre as partes, o juiz, os servidores, peritos, terceiros, enfim, todos os sujeitos envolvidos na lide. Ocorre que, além da segurança jurídica, a Constituição Federal também determina que a tutela jurisdicional deva ser prestada pelo Estado-Juiz com uma razoável duração do processo, e tal premissa faz parte da promessa maior de que a jurisdição deve ser prestada de forma justa, efetiva e tempestiva, conforme decorre do princípio do devido processo legal. Assim, nada mais justo que se promova a entrega jurisdicional antecipadamente quando evidenciado o direito de quem o postula, ou seja, quando se verifica o abuso no direito de defesa ou manifesto intuito protelatório do réu, ou ainda quando se constate que um pedido ou parcela deles seja incontroverso. Nessa esteira, a técnica antecipatória serve como importante instrumento de distribuição do ônus que o tempo do processo acarreta às partes, principalmente para aquele que tem evidenciado seu direito no curso da lide e não pode esperar até a prolação de uma sentença

A antecipação da tutela fundada na evidência

Esta monografia faz um breve apanhado sobre a antecipação da tutela fundada na evidência, ou seja, à aplicação de uma técnica antecipatória voltada a entregar tutela jurisdicional em tempo razoável tão logo o direito seja evidenciado. O processo é instrumento que se desenvolve em contraditório, obedecendo ritos que se destinam à tornar madura a causa em julgamento e que confira segurança jurídica às partes para que possam exercer adequadamente suas responsabilidades processuais. Além disso, deve obedecer um tempo de tramitação que permita a correta distribuição de responsabilidades entre as partes, o juiz, os servidores, peritos, terceiros, enfim, todos os sujeitos envolvidos na lide. Ocorre que, além da segurança jurídica, a Constituição Federal também determina que a tutela jurisdicional deva ser prestada pelo Estado-Juiz com uma razoável duração do processo, e tal premissa faz parte da promessa maior de que a jurisdição deve ser prestada de forma justa, efetiva e tempestiva, conforme decorre do princípio do devido processo legal. Assim, nada mais justo que se promova a entrega jurisdicional antecipadamente quando evidenciado o direito de quem o postula, ou seja, quando se verifica o abuso no direito de defesa ou manifesto intuito protelatório do réu, ou ainda quando se constate que um pedido ou parcela deles seja incontroverso. Nessa esteira, a técnica antecipatória serve como importante instrumento de distribuição do ônus que o tempo do processo acarreta às partes, principalmente para aquele que tem evidenciado seu direito no curso da lide e não pode esperar até a prolação de uma sentença